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R包：VennDiagram韦恩图

news 来源：原创 2024/9/24 19:15:26

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加载R包

library(VennDiagram)

数据

# Prepare character vectors
v1 <- c("DKK1", "NPC1", "NAPG", "ERG", "VHL", "BTD", "MALL", "HAUS1")
v2 <- c("SMAD4", "DKK1", "ASXL3", "ERG", "CKLF", "TIAM1", "VHL", "BTD", "EMP1", "MALL", "PAX3")
v3 <- c("PAX3", "SMAD4", "DKK1", "MALL", "ERG", "CDKN2A", "DENR", "NPC1", "NAPG")# Create a list of vectors
vlist <- list(v1, v2, v3)
names(vlist) <- c("list1", "list2", "list3")

图1

venn.diagram(vlist[1:2], filename="Venn_2way.png",imagetype="png")

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图2

venn.diagram(vlist, filename="Venn_3way.png",imagetype="png")

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图3

venn.diagram(vlist,     filename="Venn_3way_more.png",imagetype="png",main="Venn diagram",sub="3-way",main.col="red",fill=c("lightgreen", "lightblue", "lightsalmon"),col=c("lightgreen", "lightblue", "lightsalmon"),cat.col=c("green", "blue", "salmon"))

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参考

  • https://biocorecrg.github.io/CRG_RIntroduction/venn-diagram-function-from-venndiagram-package.html

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