r语言remarkdown展示图_Rmarkdown用法与R语言动态报告
数据分析用R语言非常便捷，因为R语言的社区强大，并且在不断更新和完善，提供了各种分析利器。Knitr和Rmarkdown包则是数据分析中的动态报告利器。
下面是一份输出HTML文档的Rmd文件。备忘。
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title: "Rmarkdown HandBook"
author: "Cheng"
date: "2016年9月4日"
output:
html_document:
toc: yes
number_sections: yes
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本文档主要简述Rmarkdown的基本用法。
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# Markdown语法
采用的是Markdown语法，需要快速浏览，[可以看](http://rmarkdown.rstudio.com/lesson-8.html)
插入链接
[R Project](www.r-project.org/)
R Logo:
无序列表
* unordered list
* item 2
有序列表
1. ordered list
2. item 2
***
# 基本用法
输出html，docx，pdf
需要编辑编辑YAML表头
## 选择输出格式
分别是html、pdf、docx、beamer幻灯片(pdf)、ioslides幻灯片(html)：
output: html_document html
output: pdf_document
output: word_document
output: beamer_presentation
output: ioslides_presentation
## 嵌入代码
把r换成python，就可以嵌入python代码
```{r, warning=TRUE}
1:20
```
**具体的选项：**
eval TRUE 是否估计代码的值及显示其结果
echo TRUE 显示结果时，是否也一同显示代码
warning TRUE 是否显示警告
error FALSE 是否显示错误
message TRUE 是否显示消息
tidy FALSE 是否调整代码的显示格式，使其更整洁
results "markup" "markup"(标记显示) , "asis"(文本显示) ,"hold"(末尾显示) 或 "hide"(隐藏)
cache FALSE 为了⽅便以后的提交，是否缓存结果
comment "##" 注释符号，用于结果之前
fig.width 7 由代码块⽣成的图表的宽度，英寸
fig.height 7 由代码块⽣成的图表的高度，英寸
## 提交
点击Knit按钮
生成交互式报告，需要是html格式才可以；在yaml表头插入runtime: shiny；然后点击Run Document。
其实不用shiny，单纯用html+交互式图表也可以实现网页部分交互，如Plotly图库。
# 高级用法
具体如本文件的yaml表头所示。
toc: yes表示输出目录，number_sections: yes表示目录有序号。
theme: readable主题。主题有"default" "cerulean" "journal" "flatly" "readable" "spacelab" "united" "cosmo"。
图形大小控制。在html_document下标注：fig_width: 7；fig_height: 6。
如果是自己加入CSS：
html_document:
css: my_own.css
# 具体例子
计算
```{r}
library(DT)
datatable(iris)
summary(iris)
```
散点图
```{r}
library(plotly)
plot_ly(data = iris, x = Sepal.Length, y = Petal.Length, mode = "markers",
color = Species)
```
时间序列图
```{r}
p
p %>% add_trace(y = fitted(loess(uempmed ~ as.numeric(date))), x = date)
```
# 更多的参考资料
- [Rmarkdown](http://rmarkdown.rstudio.com/index.html)
- [Cheat Sheet](https://www.rstudio.com/resources/cheatsheets/)
- Dynamic Documents with R and knitr, 2nd Edition
- Reproducible Research with R and RStudio，2nd Edition