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分子动力学后处理自编程系列（2）------聚合物回转半径

news 来源：原创 2024/5/20 3:03:25

分子动力学后处理自编程系列（2）---角分布函数

  • 1、编程思路
  • 2、计算步骤
    • (1) 读取dump文件
    • (2) 计算每个链单元的质心和链的质心
    • (3) 统计处理
    • (4) 绘图
  • 3、全部代码

在这里插入图片描述
本程序的优势主要表现在：
💖输入明确：dump文件（包含Type、mol-ID以及x，y，z）
💖简单易修改：程序思路清晰，可根据自己需求在本程序基础上进行修改实现特性需求计算，特别是针对聚合物以及蛋白质分子等复杂结构。

回转半径作为一种重要的结构表征方法，在微观研究方法中成为确定聚合物或蛋白质形态及大小的重要手段。目前对回转半径计算的后处理软件比较少，本程序可助力快速实现Rg计算。

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