R语言论文插图模板第8期—特征渲染的散点图
在之前的文章中，分享了R语言分组散点图的绘制模板：
进一步，再来分享一下特征渲染的散点图的绘制方法。
先来看一下成品效果：
特别提示：本期内容『数据+代码』已上传资源群中，加群的朋友请自行下载。有需要的朋友可以在同名公号阿昆的科研日常后台回复关键词【全家桶】查看加群方式。
1. 数据准备
此部分主要是读取原始数据，并进行绘图前的预处理。
# 加载库library(readxl)library(tidyr)library(ggplot2)# 修改工作路径# setwd("D:/R")# 读取数据data <- read_excel("data.xlsx")# 抽稀data <- data[seq(1,nrow(data),5),]# 将数据转换为数据框格式data <- as.data.frame(data)
2. 颜色定义
作图不配色就好比做菜不放盐，总让人感觉少些味道。
但颜色搭配比较考验个人审美，需要多加尝试。
这里直接使用TheBestColors配色工具中的SCI顶刊配色：
library(TheBestColors)map <- Best100(91)
3.特征渲染的散点图绘制
利用‘geom_point’函数，绘制初始特征渲染的散点图。
p <- ggplot(data,aes(x=X,y=Y,color=Feature)) +geom_point(size=0.8)+coord_fixed()+labs(x = NULL, y = NULL) +scale_color_gradientn(colors = map)print(p)
4. 细节优化
为了插图的美观，对坐标轴细节等进行美化，并按期刊所需分辨率、格式输出图片。
# 细节调整p+scale_x_continuous(expand = c(0,0))+ # x坐标轴与绘图区域边缘的扩展量scale_y_continuous(expand = c(0,0))+ # y坐标轴与绘图区域边缘的扩展量theme_classic(base_size = 8) + # 设置基本字号为8pttheme(panel.border = element_rect(size=0.2,fill = 'transparent'), # 添加全框线axis.line = element_blank(), # 删除原始轴线axis.ticks.length = unit(1, "mm"), # 设置刻度线的长度legend.position = 'right', # 设置图例位置axis.text = element_text(size = 10), # 设置坐标轴标签字号和颜色axis.text.y = element_text(angle = 90,hjust=0.5), # y轴刻度标签旋转90度legend.text = element_text(size = 10), # 设置图例文本字号axis.title = element_text(size = 10), # 设置坐标轴标题字号)# 图片导出ggsave("特征渲染的散点图.png", width = 16, height = 12, units = "cm", dpi = 600)
以上。