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生信初学者教程（十二）：数据汇总

news 来源：原创 2024/9/30 17:57:26

文章目录

    • 介绍
    • 加载R包
    • 导入数据
    • 汇总表格
    • 输出结果
    • 总结

介绍

在这里插入图片描述

在本教程中，汇总了三个肝细胞癌（HCC）的转录组数据集，分别是LIRI-JP，LIHC-US/TCGA-LIHC和GSE14520，以及一个HCC的单细胞数据集GSE149614的临床表型信息。这些数据集为科研人员提供了丰富的基因表达数据和相关的临床信息，有助于科研人员更深入地理解HCC的分子机制和临床特征。

LIRI-JP数据集包含了来自日本某研究机构收集的HCC患者的转录组数据，这些数据反映了特定条件下的基因表达情况。LIHC-US/TCGA-LIHC数据集则来源于美国癌症基因组图谱（TCGA）项目，包含了大量HCC患者的多组学数据，其中包括转录组数据，这些数据在全球范围内被广泛用于癌症研究。而GSE14520数据集则提供了另一个独立的HCC转录组数据集，用于验证和扩展的发现。

此外，还汇总了GSE149614这一HCC单细胞数据集的临床表型信息。单细胞测序技术能够揭示单个细胞内的基因表达情况，为科研工

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