首先，在官网下载最新的air sdk版本 如http://airdownload.adobe.com/air/win/download/latest/AIRSDK_Compiler.zip（这是air3.9的版本）
然后打开你的flash builder4.6的文件目录， 打开sdks文件(例如：D:\flashbuilder\flashbuilder4.6\FB4.6\Adobe Flash Builder 4.6\sdks),里面会有你现在所拥有的sdk，通常为3.6.0和4.6.0两个（也有可能是其他的数字），然后将下载好的压缩包解压到你想更新的SDK文件夹里面，所有提示都选择替换。如果你解压到3.6.0文件夹里面，那么当你建立一个项目时，选择air调试，只会在你版本选择3.6时，才会使用更新后的air版本。
方法在win8/7里面有效，但XP和MAC因为没有试过所有不能肯定，对了，一定要注意的是：为了以防万一出现特殊情况，请在覆盖前做一个备份，将原来的SDK文件复制一份保存起来，方便出现特殊情况后回档。