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【带你入门生信】什么是生物信息学

生物信息学

生物信息学:利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学,对生物学数据进行搜索(收集和筛选)、处理(编辑、整理、管理和显示)及分析(计算和模拟),提取生物信息的学科。

把生物学问题转化为计算问题。

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研究内容

中心法则视角

  • DNA/基因组:序列比对与数据库搜索,物种基因组演化距离和 DNA 的甲基化等;
  • RNA:序列比对与数据库搜索,样本间的差异化表达和共表达,以及非编码 RNA 等;
  • 蛋白质:序列比对与数据库搜索,基于质谱的蛋白质鉴定,结构预测等;
  • 分子网络:蛋白互作网络,转录调控网络,代谢和信号转导网络,网络间的动力学特征等;
  • 细胞水平:虚拟细胞模拟等;
  • 生理/病理现象:基于群体遗传学和人类遗传学的生理/病理学研究等。

数据视角

  • 数据管理:数据库系统的建立,本体论与元数据等;
  • 数据计算:算法与软件的设计,以及 Web 服务器的部署等;
  • 数据挖掘:生物学发现;
  • 建模与仿真:建立预测模型并模拟生物学系统等。

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