生信初学者教程（七）：数据库
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文章目录
- Gene Expression Omnibus
- ICGC Data Portal
- Genomic Data Commons Data Porta
- 其他数据库
Gene Expression Omnibus
Gene Expression Omnibus（GEO）数据库是一个公共基因表达数据存储库，由美国国家生物技术信息中心（NCBI）维护。它收集了来自各种生物学研究的高通量基因表达数据，包括微阵列芯片、RNA测序和蛋白质质谱数据等。这些数据可用于生物学研究、生物信息学分析和假设测试。可以通过： 1. 搜索数据集： 在网站的搜索栏中输入您感兴趣的关键词、基因名、实验类型等，然后点击“Search”按钮。 2. 选择数据集： 根据搜索结果浏览并选择您感兴趣的数据集。您可以通过查看摘要、样本信息以及相关文献来确定是否选择特定数据集。 3. 下载数据： 在所选数据集的页面上，通常会提供下载选项。您可以选择下载原始数据文件或相关的元数据文件，如样本信息、实验设计等。 4. 确认下载： 点击下载链接或按钮，然后根据提示确认下载。您可能需要注册或登录NCBI账户才能下载某些数据集。