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star 序列比对2020-12-25

 

mkdir -p arab_STAR_genome        #存储索引文件用

cd  rnaseq/ 

STAR --runThreadN 10 --runMode genomeGenerate \    
--genomeDir arab_STAR_genome \
--genomeFastaFiles 00ref/TAIR10_Chr.all.fasta \
--sjdbGTFfile 00ref/Araport11_GFF3_genes_transposons.201606.gtf \
--sjdbOverhang 149

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